新型微波烘烤机的原理是用磁控管将电能转换成微波。在加热过程中，在微波电场的作用下，物质分子将以每秒24.5亿次的频率振荡。分子在高频磁场中振动并相互碰撞，产生热能，导致物质被加热。新型微波烘烤机的优点是微波是电磁波。这种电磁波的能量比普通无线电波大得多，其波长可达120毫米，能穿透深度达120毫米的物质。加热是整体加热(即内外同时加热)，传统加热方式的热量不是从材料表层传导的。因此，加热速度快，效率高，安全环保。

新型微波烘烤机的发展也是人们对生活质量要求不断提高的一个过程，因为它与人们的饮食生活息息相关。虽然灭菌的方式有很多，但人们出于对环保和经济的要求，很多还是会选择微波烘烤机，食品行业的相关设备不断发展，微波烘烤机的自动化发展使得其在别的行业中也用处更加，比如医疗和高科技领域，但是工业中用处还相对较少。新型微波烘烤机在特定条件下的杀菌效果与设备性能还有一定要求，否则将影响食品质量等，搞清微波杀菌的机理对于推广实际应用具有重要的意义。

新型微波烘烤机是利用微波加热进行快速加热的，使物料中的水分吸热汽化，从而带动食品物料组织膨化的一种新的常压膨化技术。微波膨化由于其加热速度快，食品受热时间短，相对于挤压膨化、油炸膨化而言，其不易造成食品某些不必要的化学反应，且不增加食品的油脂，新型微波烘烤机能较好地保留了制品原有的风味，因此微波膨化应用于淀粉类食品（如玉米、糯米、小米）、蛋白类食品（如大豆等）、两者混合的食品（如虾片等）。而米制小食品是微波膨化很好的应用方向。

新型微波烘烤机是频率在300兆赫到300千兆赫的电波，被加热介质物料中的水分子是极性分子。它在快速变化的高频点磁场作用下，其极性取向将随着外电场的变化而变化。造成分子的运动秀相互摩擦效应，此时微波场的场能转化为介质内的热能，使物料温度升高，产生热化和膨化等一系列物化过程而达到微波加热干燥的目的。新型微波烘烤机的非热效应是指除热效应以外的其他效应，如电效应、磁效应及化学效应等．使细胞膜功能受到影响，使细胞膜内外液体的电状况发生变化