专业微波灭菌设备主要应用于食品的干燥与杀菌。食品在深加工过程中，干燥与杀菌的工艺是不可避免的，基本上不用干燥的食品都需要用到杀菌。食品加工过程中干燥有几种方式，干燥的温度都不一样。食品杀菌设备也是有很多种方式，目前主要使用微波杀菌设备，微波干燥时候的时候可以起到杀菌的效果，但是食品杀菌的时候对食品的干燥起不到主要的作用，因为食品微波杀菌的时候只烘干5-10%的水分，所以食品烘干高水分的时候主要是干燥为目的。那么专业微波灭菌设备主要就是以干燥为目的的微波设备，也起到了对食品的杀菌作用。

专业微波灭菌设备在快餐行业的应用。盒饭配送其优点是产量高、连续快速。其温度要求在不破坏饭菜的营养成分的风味时同时由于加热过程中微波的热效应和非热效应共同的作用对饭菜起到了杀菌作用满足了食品的卫生指标要求微波加热盒饭是目前大型盒饭加热设备的选择。专业微波灭菌设备是利用微波的交变频率，能使极性分子在较短的时间内达到快速加热和回温的目的；并且利用自身产生的热效应和生物效应，杀灭物料中的霉菌、大肠杆菌及致病菌，从而使一些快餐企业在生产过程中采用隧道连续式微波设备对盒饭进行快速回温、杀菌效果。

专业微波灭菌设备在药材行业的应用已经一个成熟的烘干机设备，经过微波行业的良性发展，越来越多的企业选择了微波烘干机对药材进行烘干。由于微波的特性，采用微波烘干后的药材，可以大限度保持其原有的药物成分，减少药物成分的流失。还可以保持药材烘干前原有的色泽。微波烘干机使用的是电能，其属于一种简洁的能源，可以大大改善生产环境。专业微波灭菌设备比传统的烘干方法烘干速度要快很多，大大地提高了生产效率。在食品、农副产品等需要做杀菌处理的，在对其烘干的同时，还可以对其进行杀菌处理

专业微波灭菌设备适合于热敏性物料的干燥，能很好的保持产品批量的稳定性和一致性。工业生产中，由许多物品是不能在高温条件下进行干燥处理，专业微波灭菌设备是微波能技术与真空技术相结合的一种新型微波能应用设备，它兼备了微波及真空干燥的一系列优点，克服了常规真空干燥周期长、效率低的缺点，在一般物料干燥过程中，具有干燥产量高、质量好、加工成本低等优点。工业生产中，由许多物品是不能在高温条件下进行干燥处理，如一些药品、化学制品、营养食品 以及人参、鹿茸等中草药材，为了保证产品质量，其干燥处理需要在低于 100 ℃或室温的条件下进行。