新型微波灭菌设备的原理是用磁控管将电能转换成微波。在加热过程中，在微波电场的作用下，物质分子将以每秒24.5亿次的频率振荡。分子在高频磁场中振动并相互碰撞，产生热能，导致物质被加热。新型微波灭菌设备的优点是微波是电磁波。这种电磁波的能量比普通无线电波大得多，其波长可达120毫米，能穿透深度达120毫米的物质。加热是整体加热(即内外同时加热)，传统加热方式的热量不是从材料表层传导的。因此，加热速度快，效率高，安全环保。

新型微波灭菌设备备是利用了电磁场的热效应和生物效应的共同作用的结果。微波对细菌的热效应是使蛋白质变化，使细菌失去营养，繁殖和生存的条件而死亡.微波对细菌的生物效应是微波电场改变细胞膜断面的电位分布，影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，新型微波灭菌设备微波对细菌的生物效应是微波电场改变细胞膜断面的电位分布，影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细菌因此营养不良，不能正常新陈代谢，细胞结构功能紊乱，生长发育受到抑制而死亡。

新型微波灭菌设备的发展也是人们对生活质量要求不断提高的一个过程，因为它与人们的饮食生活息息相关。虽然灭菌的方式有很多，但人们出于对环保和经济的要求，很多还是会选择微波灭菌设备，食品行业的相关设备不断发展，微波灭菌设备的自动化发展使得其在别的行业中也用处更加，比如医疗和高科技领域，但是工业中用处还相对较少。新型微波灭菌设备在特定条件下的杀菌效果与设备性能还有一定要求，否则将影响食品质量等，搞清微波杀菌的机理对于推广实际应用具有重要的意义。

新型微波灭菌设备 根据车间环境卫生情况，合理安排设备电器、箱体、传送带等部位的清理工作，尤其是风冷微波烘干机，更需要注意这一点。如果尘埃积的太多散热效果就会变差，所以要定时及时清理磁控管、变压器表面，否则机器距离烧毁的时间也就不远了，特别是一些会导电的粉尘。2、保持干燥的车间环境。微波电器件都是金属制作的，车间湿度大，金属电器表面会比较潮湿，在接通电源时，附着在金属电器表面的水汽会造成电器短路，从而烧毁电器。3、定期打开新型微波灭菌设备箱体观察窗，清理箱体里面的杂物。箱体内的杂物会影响微波有效使用功率。